今年4月，由于反核电组织的抗议，台湾当局宣布龙门1号机组一旦通过运行前测试，就会被立即封存，2号机组的建设工作也会同时中止，两机组的最终命运将由全民公投决定。
台湾“经济事务部”部长宣称，台湾龙门核电站1号机组运行前的126项测试工作已经顺利结束，“达到了规定的要求”，明年开始将进入封存期，第一阶段为期三年。选择封存而不是关闭核电站为的是将来能够更加灵活的进行处理。
龙门核电站运营商台湾电力公司已经支付了封存和第一年的维护费用共13亿新台币（4300万美元），预计三年总的费用约为20亿新台币（6700万美元）。台湾当局宣布，尽管龙门核电站项目自1999年以来的总投资达到了3000亿新台币（100亿美元），但在公投结果出来之前，不会对其进行任何新的投资。两台机组原计划分别于2006年和2007年投入商业运行。